يسعى مركز قيم في المدرسة إلى تعزيز القيم الطيبة في نفوس الطلاب وفق خطة فصلية موزعة على أشهر الفصل، وقد تضمن الفصل الأول قيماً مهمة، ففي شهر سبتمبر عمل المركز على تعزيز قيمة الاحترام (احترام العلم، احترام أنظمة المدرسة، احترام المعلمين والإداريين، احترام الزملاء والتعاون معهم، احترام خصوصية الحصة ... ).
بالإضافة إلى قيمة النظام (التقيد بوقت الحصة وعدم إضاعتها، النزول والرجوع من الصلاة دون تأخير، المحافظة على الممتلكات، الانضباط في الطابور، الدور في المقصف).
وفي شهر أكتوبر، فقد ركز على تعزيز قيمة التوازن بين العلم والإيمان والتوازن بين الأصالة والتجديد. (ومن ذلك احترام التراث الثقافي والحضاري لدولة قطر -الماضي والحاضر-).
أما في شهر نوفمبر، فقد تمت العناية بقيمة الاعتزاز بالتميز والإبداع
وقد قام المركز بإجراءات عديدة من أجل تعزيز هذه القيم، منها: ورشة الاحترام والنظام بالتعاون وورشة الطريق نحو القمة مع قسم الدعوة والإرشاد بوزارة الأوقاف، ومجلة قيم وهي مجلة حائطية شهرية يتابعها الطلاب ويثرونها، وديوان الحفاظ والمجازين بالتعاون مع قسم التربية الإسلامية في المدرسة، ومنها لقاءات هادفة مع الطلبة، واستقبال لدعاة ومحاضرين ومدربين متميزين، ومنها الأنشطة الترفيهية القيمية داخل المدرسة وخارجها في الإجازات الأسبوعية بالشراكة مع مؤسسة الشيخ عيد الخيرية، ومنها مسرحية احترام النعمة وتمثيلية الاحترام وأنشودة (نحن للعلم جنود) وكل ذلك من أداء الطلبة في المدرسة، ومنها المشاركة في زراعة الأشجار النافعة بالتشارك مع مؤسسة الشيخ عيد، ومنها مسابقة أجمل صف على مدار الفصل، ومنها إقامة صلاة الظهر جماعة في المدرسة وقراءة بعض الأحاديث المختارة من رياض الصالحين بعد الصلاة، على أن يقوم بالإمامة أحد طلاب ديوان الحفاظ والمجازين، وأن يقوم بإلقاء فقرة الحديث على المصلين سائر طلاب المدرسة (كل يوم واحد).